柱温箱又叫色谱柱恒温箱。在液相色谱分析系统中，对柱温箱温度控制的要求非常高，由于液相柱温箱可以、稳定地控制色谱柱的工作温度，有效地提高柱效，改善色谱峰的分离度、峰形对称性，缩短保留时间，降低柱反压，减少泵的磨损，保证分析样品结果的准确性和重复性，柱温箱作用不可忽视。因此，柱温箱成为液相色谱仪的重要配套装置。液相色谱仪的温控系统是由温控器及柱温箱组成，通过设定温度，温控系统可以避免色谱柱温度受外界的影响，从而保持柱温恒定对保证分析结果的重复性、准确性有非常重要的作用。
在大容量柱温箱中存在两相，一相是固定不动的，即固定相；另一相则不断流过固定相，即流动相。大容量柱温箱的分离就是溶于流动相中的各组分经过固定相时，由于与固定相发生作用的大小、强弱不同，在固定相中滞留时间不同，从而先后从固定相中流出的分离过程来进行分离。柱温箱更详细地说就是使用外力使含有样品的流动相通过与流动相互不相溶的固定相表面。当流动相中携带的混合物流经固定相时，混合物中的各组分与固定相发生相互作用。大容量柱温箱由于混合物中各组分在性质和结构上的差异，与固定相之间产生的作用力的大小、强弱不同，随着流动相的移动，混合物在两相间经过反复多次的分配平衡，使得各组分被固定相保留的时间不同，从而按一定次序由固定相中先后流出，从而实现混合物中各组分的分离与检测。
柱温箱对于流动相温度的控制目前没有很好的方法，即使是整个室内使用空调也难于使流动相的温度保持一致，因此，目前大多采用柱温箱控制柱温的方法，使用柱温箱能耗低，控温精度高，是液相色谱仪*的辅助设备。
